空間轉錄組測序


空間轉錄組測序是在組織原位檢測全轉錄組基因表達的一種技術,可以展示組織切片中不同區域的基因表達情況,同時能夠得到目的基因在組織內部的空間位置信息。與傳統的全基因轉錄組或單細胞轉錄組測序相比,空間轉錄組測序漿病理影像(H&E染色)與測序數據映射在一起,進而可以分析組織切內部空間結構的細胞異質性。


1.技術優勢


① 平臺穩定:不需要單細胞解離,組織切片即可;

② 周期短:從樣本處理到建庫僅需一天;

③ 可視化:Space Ranger可視化數據分析;

④ 空間定位:結合scRNA-seq可實現基因空間定位;

⑤ 兼容性強:人、小鼠、大鼠組織;新鮮冷凍樣品和石蠟樣本均可;

⑥ 應用領域廣:腫瘤異質性、免疫浸潤、空間發育圖譜構建、神經疾病特征、病理基因表達區域鑒定等;